星历4088年,人们引起了星系间的危机，失去了大多数的惑星。残存于星间殖民地的人类，将希望寄托在仅存唯一的惑星"ZION"上，但是ZION却被不明的外星生物"牺牲者"(威克提姆 Ｗｈｉｇｔｏｍ)所威胁，人们只好使用巨大的机械人型兵器"女神"(英格莉德 Ａ·Ｈ·Ｗ)来对抗威克提姆。
但是女神的驾驶员必须要拥有超越常人的特殊能力(EX)，工作十分辛苦，任期又十分短暂，所以便有了女神的驾驶员训练中心"G.O.A"的诞生，每一期的训练时间为三年。在三年的学习期间内，学员们(即女神候补生)必须在宇宙船内生活，接受严格的训练，因此半途而废者不在少数。而且并非三年的在学期间一结束就可以成女神的驾驶员，只有缺额出现(现任驾驶者死亡或因EX低下而引退)或者是候补生的战斗能力超越现任驾驶员，才可以晋升为正式驾驶员。
然后时间到了星历5030年……
主角杰洛·苑名(ZER...
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